В Академгородке ходит много легенд, связанных с историей и жителями. Одна из самых распространенных легенд гласит о дяде Мише, который был математиком и вывел формулу, по которой можно было определить продолжительность жизни. Есть также легенда о подземном городе, где якобы ученые готовят ядерную бомбу. В Академгородке много бомбоубежищ, но подземного города на самом деле нет.